Sobald die PAM-Software installiert ist, kann sie aufgerufen werden. Zum Zeitpunkt des Aufrufs muss einer der konfigurierten Datenbank-Server laufen. Deshalb sollte der zentrale Datenbank-Server unter Windows 7, Windows 8 oder Windows 10 möglichst als Service eingerichtet sein, damit er unabhängig von einem Benutzerlogin verfügbar ist. Wenn keine Datenbank erreichbar oder dem Programm bekannt ist, so kann nicht mit PAM gearbeitet werden. Sollten Probleme bei der Verbindung zu einer Datenbank auftreten, so kann das daran liegen, dass der Port 3050 nicht in der Firewall freigegeben ist. Dieser wird vom Datenbankserver benötigt.

Bei den älteren Versionen von PAM wurde nicht zwischen verschiedenen Benutzern unterschieden, da die Anmeldung stets über das Administratorpasswort erfolgte. Auch die neue Version des Programms geht üblicherweise davon aus, dass der Benutzer sich als Datenbankadministrator mit dem vorgegebenen Standardpasswort anmeldet. Darüber hinaus räumt PAM jedoch auch die Möglichkeit ein, verschiedene Benutzernamen zu verwenden und diese auf Datenbankebene mit individuellen Rechten auszustatten (Näheres dazu folgt unter dem Punkt Datenbanken). Zu diesem Zweck ist es notwendig, dass der Systemadministrator diese Benutzernamen (samt Passwort) auf jedem Datenbankserver, auf dem der entsprechende Benutzer zum Arbeiten autorisiert sein soll, gesondert anlegt.

Das Verwenden von verschiedenen Benutzernamen bietet beispielsweise den Vorteil, dass die Administratorpasswörter der einzelnen Datenbankserver nicht notwendigerweise offen gelegt werden brauchen. Außerdem ist es möglich, bestimmten Benutzern den Zugriff auf einzelne Datenbanken oder -server zu verweigern.

Ein Nachteil bei der Verwendung verschiedener Benutzernamen besteht darin, dass dieses Konzept nur dann Sinn ergibt, wenn das öffentlich bekannte Standardpasswort (MASTERKEY) des Datenbankadministrators (SYSDBA) geändert wird. Ist dies der Fall, so funktioniert (auf lokaler Ebene) eine Routine des Programms, mit der dieses feststellen kann, ob bestimmte Datenbanken vorhanden sind, nicht mehr. Daher ist es notwendig, in der Datei pam.ini den Eintrag expectDatabaseIsReachable auf true zu setzen. Weiterhin müssen die Einträge DatabaseUser und DatabasePassword jeweils auf pamuser gesetzt werden und im Firebirdsystem ein entsprechender Benutzer mit diesem Passwort angelegt werden.

Ist der PAM-Client auf einem Rechner installiert, kann das Programm durch einen Doppelklick auf das PAM-Shortcut im Installationsverzeichnis gestartet werden. Es erscheint ein Startfenster, in dem eine der bekannten Materialdatenbanken ausgewählt werden kann. Der Name der gewünschten Datenbank braucht dabei nicht eingegeben werden, sondern wird über eine Auswahlbox angewählt.

Über den Befehl Datenbanken lassen sich Datenbanken Neu Anlegen, Hinzufügen, Kopieren oder Löschen.

Bereits erstellte Datenbanken können zusätzlich über die Funktion Konfigurieren angepasst werden.

Gegebenenfalls müssen noch zusätzliche Angaben gemacht werden, etwa der Benutzername und das Passwort. Dies ist jedoch nur dann der Fall, wenn die vorgegebenen Standardwerte nicht mit den benötigten Werten übereinstimmen. Als Standardwerte werden immer der zuletzt verwendete Benutzername, sowie ein (verschlüsselt) gespeichertes Passwort verwendet (siehe Abschnitt Datenbanken).